冒険者予備校の特待生クラスに入ったヴェルだが初日から浮いてしまう。彼の魔法の才能を聞きつけたルイーゼ、イーナ、エルはパーティメンバーに誘おうと動き始めるが…！？ブライヒレーダー辺境伯の園遊会に招かれたヴェルは筆頭お抱え魔法使いブランターク・リングスタットと対面する。

東京で一旗揚げようと、中学の先輩である金田一京助を頼り上京した天才歌人、石川啄木は創作をそっちのけで酒と女にうつつを抜かし万年金欠状態。そんな折、二人は殺人事件の第一発見者となる。被害者は荒川銅山の使用人の達吉。容疑をかけられた二人だが啄木の推理でその場を逃れる。見事な推理に京助は感心する。

米軍のミサイルネットワークが乗っ取られた。標的は東京！タイムリミットが迫るなか、新しい仲間・石田ヤマトやガルルモン達と一緒に事態の収拾を試みる太一。しかし敵のボスは進化を重ね、グレイモンやガルルモンの攻撃も効かなくなってしまう。絶望的な状況に降臨したのはオメガモンだった！！