ドクトルでさえ手に負えなかった幻獣の檻に落ちてしまったリーゼ。絶体絶命の中、猛獣使いの真価が試される！勝とコロンビーヌはしろがね‐Oの本体が眠る部屋に到着し、彼らの秘密を目の当たりにするのだが…。

リーゼは姉を死に追いやった仇と戦闘を開始！先を急ぐ勝だが最古のコロンビーヌに見つかってしまう！人間とオートマータの価値観の違い。戦いになるかと思われたが、勝をしろがねOの攻撃から守ったのはコロンビーヌで…！？

奪還したハリーと生存者を乗せた列車はゾナハ病研究所からの脱出を試みる！殿を買って出たギイだが、ついに限界を迎え戦闘不能に！オートマータがトドメを刺そうと殺到する中、助太刀に現れたのはなんとパンタローネだった！！

新型のしろがね-Oであるシュナージーに歯が立たないジョージ。パンタローネと戦う阿紫花も苦戦を強いられ、刀で脇腹を貫かれてしまう。死を覚悟した彼だがとある作戦を思いつき…！？デモン鳴海は子供たちを救うべく戦い続ける！

ギャンブラー・ジョーンズとの戦いで追い詰めれらていくミンシア！さらにオートマータの援軍が到着し、戦いは激しさを増していく。上位互換の敵を前にジョージは劣勢！？阿紫花の前に立ちはだかったのは最古のパンタローネだった！

フェイスレスによってゾナハ病が世界中にばら蒔かれた！リーゼと飛行船を追跡する勝。鳴海とギイは完成したゾナハ病治療マシーンを守るため研究所へ向かう！一方、復活した最古の3人は亡きフランシーヌ人形そっくりのエレオノールと出会い…。

目の前の「勝＝貞義」だと尚も疑うギイと正二。だが黒賀の男が口を開き、バイ・ジンの空白の時間を語り始める。変装を解いた男の正体。それは死んだはずのフェイスレス司令で…！彼とディーン、貞義、そして始まりの男バイ・ジンは全て同一人物だった！

アクアウイタエを飲み《しろがね》となってしまったエレオノールを守るため、正二とギイは彼女をキュベロンに送り込む。37年が経ち、ようやくエレオノールに再会した正二だが、目にしたのは人形の様になってしまった我が子で…。才賀貞義の恐るべき計画も明らかになる！

赤ん坊のエレオノールと接するうちギイやフランシーヌ人形の様子に変化が見え始める。ある夜、才賀家にオートマータの大群が襲来。去るように命じたフランシーヌ人形だが、オートマータはなぜか命令を聞かず…！彼らの目的とは！？

正二とアンジェリーナの子供はエレオノール！貞義は養子で、かつてディーン・メーストルを名乗る《しろがね》だった！しかもその外見はジンに瓜二つで…！？アンジェリーナと少年ギイ、正二とフランシーヌ人形の接点が明かされる！